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光明日?qǐng)?bào)重慶8月28日電?記者黃漢鑫、張國(guó)圣日前從西南大學(xué)油菜分子生物學(xué)研究團(tuán)隊(duì)獲悉,該團(tuán)隊(duì)通過(guò)甘藍(lán)型油菜黃籽GH06和黑籽中油821高質(zhì)量基因組的組裝,圍繞控制種皮色澤主效QTL區(qū)間,成功克隆了一個(gè)控制油菜種皮色澤重要基因,并解析了其參與調(diào)控種皮色澤形成和類(lèi)黃酮代謝的分子機(jī)制,為油菜品質(zhì)性狀改良提供了新的分子策略。
油菜是我國(guó)重要的油料作物,其種子中富含的色素與多酚物質(zhì)不僅參與非營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的積累,更直接影響種皮發(fā)育中色澤的變化。目前,黃籽性狀是油菜品質(zhì)改良的重要目標(biāo)之一,但自然界中不存在天然的黃籽種質(zhì),主要通過(guò)蕓薹屬作物種間雜交獲得,且易受環(huán)境因素影響。前期研究證明,影響粒色變化的色素差異物質(zhì)及其衍生物可通過(guò)類(lèi)黃酮途徑的多個(gè)分支形成,涉及多個(gè)基因參與調(diào)控,但具體的調(diào)控機(jī)制不清楚,因此培育穩(wěn)定遺傳的黃籽優(yōu)異品系較為困難。
據(jù)研究團(tuán)隊(duì)李加納教授介紹,團(tuán)隊(duì)通過(guò)二代(Illumina)和三代(PacBio)基因組測(cè)序,結(jié)合Hi-C技術(shù)輔助組裝,獲得甘藍(lán)型油菜黃籽GH06和黑籽中油821高質(zhì)量基因組圖譜,進(jìn)而在對(duì)粒色性狀傳統(tǒng)QTL定位基礎(chǔ)上,結(jié)合多組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)編碼R2R3-MYB型轉(zhuǎn)錄因子的BnA09MYB47a是控制黃籽性狀的主要候選基因。
通過(guò)對(duì)過(guò)表達(dá)/沉默BnA09MYB47a轉(zhuǎn)基因油菜研究,發(fā)現(xiàn)該基因與種皮色澤呈現(xiàn)正相關(guān),還影響了蕓薹屬作物種皮色澤性狀的重要組成成分表兒茶素、山奈酚、異鼠李素和花青素苷及其衍生物等類(lèi)黃酮代謝產(chǎn)物的合成。
這一研究豐富了甘藍(lán)型油菜參考基因組數(shù)目,特別是繼唯一已公布的No2127黃籽參考基因組之后補(bǔ)充了新的黃籽基因組,為黃黑籽油菜基因組深入研究、優(yōu)異基因資源的挖掘利用,培育高商業(yè)價(jià)值的油菜,促進(jìn)蕓薹屬作物中黃酮類(lèi)化合物合成代謝調(diào)控的分子機(jī)制研究提供理論依據(jù)和資源。
《光明日?qǐng)?bào)》(2023年08月29日?08版)