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中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心合成生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員張余團(tuán)隊(duì)和美國威斯康星大學(xué)麥迪遜分校Robert Landick團(tuán)隊(duì)、浙江大學(xué)馮鈺團(tuán)隊(duì)合作,揭示了細(xì)菌核糖核酸(RNA)聚合酶識(shí)別轉(zhuǎn)錄終止序列、終止轉(zhuǎn)錄的工作機(jī)制。1月12日,相關(guān)論文發(fā)表于《自然》。
脫氧核糖核酸(DNA)是遺傳信息的載體,遺傳信息通過轉(zhuǎn)錄從DNA傳遞到RNA,隨后通過翻譯解碼成蛋白質(zhì)。基因是DNA遺傳信息的編碼單元,基因的正確解碼需要執(zhí)行基因轉(zhuǎn)錄的RNA聚合酶嚴(yán)謹(jǐn)識(shí)別基因的起始序列(啟動(dòng)子)和終止序列(終止子)。如果轉(zhuǎn)錄終止過程發(fā)生異常,會(huì)干擾下游基因的表達(dá)、影響DNA復(fù)制、破壞基因組穩(wěn)定性等。
“RNA聚合酶在執(zhí)行基因轉(zhuǎn)錄時(shí)類似高速行駛的汽車,以大約每秒50個(gè)核苷酸的速度合成RNA。當(dāng)RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄至終止序列時(shí),需要從高速延伸的狀態(tài)‘剎車’,停止轉(zhuǎn)錄并釋放RNA?!睆堄嘟榻B說,“細(xì)菌的固有轉(zhuǎn)錄終止序列是一段30至50個(gè)核苷酸堿基的序列,由能夠形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)的序列和連續(xù)多聚尿苷組成?!?/p>
研究團(tuán)隊(duì)捕獲了RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄終止的一系列中間狀態(tài),解析了RNA聚合酶在上述轉(zhuǎn)錄終止中間狀態(tài)的冷凍電鏡三維結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄終止序列的多聚尿苷使RNA聚合酶“剎車”,將其固定在轉(zhuǎn)錄暫停狀態(tài),隨后RNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)折疊進(jìn)入RNA聚合酶內(nèi)部,促使RNA從RNA聚合酶內(nèi)部解離。
該研究報(bào)道了細(xì)菌RNA聚合酶在基因轉(zhuǎn)錄終止序列暫停轉(zhuǎn)錄、RNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)折疊進(jìn)RNA聚合酶內(nèi)部誘導(dǎo)RNA釋放的分子機(jī)制,回答了基因表達(dá)的基礎(chǔ)科學(xué)問題,拓展了人們對(duì)基因表達(dá)機(jī)制的理解。(張雙虎 黃辛)